Le Logiciel et les données associées sont hébergés en région parisienne, sur des serveurs administrés par Scaleway France, leader européen des services d’hébergement et d’infogérance d’applications critiques. Scaleway est certifié PCI-DSS et ISO 27001.

Scaleway fournit un service de protection et de contrôle contre les cyber-menaces sur tous les serveurs ainsi qu’une mise à jour des logiciels d’exploitation de Sellsy en temps réel. Sellsy bénéficie du plan d’assurance sécurité de l’hébergeur, qui a notamment mis en place un système de détection et d’extinction d'incendie automatique à gaz.